दिनांक 01.07.2017 से विभाग के पुनर्गठन के बाद, आयुक्त (अपील-II) का गठन अधिसूचना संख्या 17/2017-सीई (एनटी) दिनांक 19.06.2017 एवं 02/2017-सीटी दिनांक 19.06.2017 के साथ पठित अधिसूचना संख्या 13/2017-सीई (एनटी) दिनांक 09.06.2017 के अधीन हुआ। इसका भौगोलिक क्षेत्राधिकार केंद्रीय कर अधिसूचना की तालिका- II के क्रम संख्या 65 और 92 में किये गये उल्लेकख के अनुसार तेलंगाणा राज्य के निर्दिष्टौ भागों पर लागू है जिसमें मेड्चल जीएसटी आयुक्तालय और सिकंदराबाद जीएसटी आयुक्तालय शामिल हैं।
अपील - II आयुक्तालय केंद्रीय उत्पाद शुल्क, सेवा कर और केंद्रीय कर के संबंध में उपर्युक्त क्षेत्राधिकार में पारित आदेशों से उत्पन्न होने वाली अपीलों को संभालता है। आयुक्त (अपील - II) केंद्रीय उत्पाद शुल्क, सेवा कर और जीएसटी मामलों के संबंध में अपील को संभालते हैं जबकि अपर आयुक्त / संयुक्त आयुक्त (अपील - II) केवल जीएसटी मामलों के संबंध में पारित आदेशों से उत्पन्न होने वाले मामलों को संभालते हैं।